write.csv(data, "C:/hoge/fuga.csv")
実際にはdataは当該データフレームの変数名，""内は保存したいディレクトリのパスを入力する．
ディレクトリ（フォルダ）間の区切りには円マークやバックスラッシュを使うことが一般的だが，Rはスラッシュを使うのでそこだけ書き換える．
なお，上記のやり方でcsvファイルを作成すると，各行の先頭に行の番号が勝手に出力される．
それを回避したい場合は，オプションで row.names = FALSE をつける．
すなわち，以下のようにする．
write.csv(data, "C:/hoge/fuga.csv", row.names=FALSE)
データを""で囲いたい 
数値を三桁ごとにカンマで区切りたい場合などは，""で数値を囲む仕様にすることがcsvでは一般的だろう．
データを""で囲みたい場合は， quote = TRUE をオプションにつければよい．
色々カスタマイズしたい場合は，いっそ write.table を使う？
write.csv は write.table をオーバーライドした関数なので，もっと自分がやりたいようにファイル出力をしたい場合はいっそ write.table を使う方がいいかもしれない．